Семья Юры переезжает из Токио в провинцию, и мальчику приходится поступить в христианскую школу. Юра изо всех сил старается понять уклад школьной жизни, когда внезапно в его жизни появляется миниатюрный Иисус....

Спустя десять лет после известных трагических событий синдром Киры возвращается на планету. После длинной серии внезапных смертей спецслужбы понимают, что Тетрадь смерти снова с нами. Агент Цукуру Мисима и его команда узнают, что тетрадей теперь...